Kesiswaan SMK Ma'arif NU 1 Cilongok dibawah pimpinan Aziz Masruri, S.H. selaku Wakil Kepala bidang Kesiswaan, memiliki tema Unggul, Tangguh, Enjoy, dan Karakter (UTEK).

Kesiswaan SMK Ma'arif NU 1 Cilongok membawahi organisasi-organisasi peserta didik dan kegiatan ekstrakurikuler SMK Ma'arif NU 1 Cilongok.

Adapun organisasi dibawah Kesiswaan sebagai berikut:

1. OSIS (Organisasi Intra Sekolah)

2. Pramuka

3. PMR

4. IPNU-IPPNU (Ikatan Pelajar Nahdlatul Ulama - Ikatan pelajar Putri Nahdlatul Ulama)

Sedangkan ekstrakurikuler di SMK Ma'arif NU 1 Cilongok adalah sebagai berikut:

1. Atletik

2. BTQ (Baca Tulis Al Qur'an)

3. English Club

4. Musik

5. Tari

6. Teather

7. Ekstrakurikuler jurusan

8. Sepak bola

9. Volly

10. Hadroh

11. Pencak silat

12. Kenthongan

13. Jurnalistik

14. Pramuka

15. Petanque